Amino Acid Synthesizer
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Amino Acid Synthesizer

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  • MIT Laboratory for Atomistic & Molecular Mechanics

该应用具有用于氨基酸序列的自洽性超声

关于此应用程序

该应用程序使用一种自洽的方法将氨基酸序列转化为可听见的声音。 SONIFIENT方法使用蛋白质的氨基酸构建块的正常模式振动来计算20种天然氨基酸中每一种的可听见,这是由其各自的自然振动的覆盖层充分定义的。振动频率是按照座椅等效性的音乐概念,播放或写音乐的方式,以使其在音调上听起来更高或更低的方式,同时保持音调或和弦之间的关系。这种换位方法可确保保留每个氨基酸内振动频率的相对值,并保留不同的氨基酸。

与每种氨基酸相关的特征频谱和声音代表了一种音乐量表,其中包含20个独特的音调,即“氨基酸尺度”。要创建可播放的乐器,将与氨基酸相关的每个音调都分配给手机屏幕上的特定键,可以播放。该应用程序允许用户记录播放,编辑它们并共享其进一步处理的序列(例如,基于组成的音乐创建合成蛋白,或预测通过音乐创建的序列的折叠结构)。

创建蛋白质序列音频表示的方法为理解序列模式,变化和突变提供了新的途径,并提供了一种外展机制来解释蛋白质序列的重要性。这里报告的方法还可以洞悉通过声音的突变效果。

科学出版物:

[1] Yu,Ch,Qin,Z.,Martin-Martinez,F。和Buehler,MJ,一种自洽的超声词方法,将氨基酸序列转化为使用AI在蛋白质设计中使用AI中的音乐组成和应用。

Eric L. Buehle开发的应用

版本 Amino Acid Synthesizer